一維或二維電泳后的蛋白質通常由于染色步驟而沉淀或與凝膠介質共價交聯(lián)而固定在凝膠,所以從聚丙烯酰胺凝膠中回收高質量、完整的蛋白質并不容易。Top-Down蛋白質組學發(fā)展緩慢,很大程度上是因為樣品前處理要求非常嚴格,尤其是從聚丙烯酰胺凝膠中回收高質量的完整蛋白質。
借助微流控技術的發(fā)展,Protea公司開發(fā)出了GPR-800樣品回收系統(tǒng),一種基于微流控技術,采用動電力和水動力相結合的辦法將蛋白質的流動路徑和電泳電場方向分離,從聚丙烯酰胺或瓊脂糖凝膠中回收生物分子(如:蛋白質、多肽和核酸)用于后期分析。系統(tǒng)包含主機和微流控芯片,主機GPR-800對每個通道施加500V的電壓,20分鐘內(nèi)快速的回收樣品,每個GPR芯片可以同時處理8個樣品,從而達到大通量樣品處理的能力。
特點:
使用專利GPR微流控芯片,高效回收低至100ng電泳上樣量的蛋白質,芯片和液體接觸面積小,將蛋白質表面吸附的損失降到最低,提高蛋白質的回收率;
8通道平行處理,20分鐘內(nèi)能同時處理8個樣品,一個工作日可以處理超過100個凝膠蛋白質位點;
500V高壓電洗脫,蛋白質流動方向和電場方向分離的回收技術,操作簡單,回收率高,易于電洗脫后樣品的純化;
回收系統(tǒng)和配套試劑與質譜兼容,回收后的蛋白質可以很方便的用于質譜分析,無需費時的樣品純化步驟;
密閉系統(tǒng)和一次性耗材,無需擔心外來污染或樣品交叉污染;
使用GPR-800回收二維電泳分離的肌紅蛋白異構體,完整蛋白質分子量測定表明每個位點都具有不同的分子量。這種方法可以使研究者很容易的使用凝膠電泳進行蛋白質異構體的相對定量和分離,并從凝膠中快速高效的回收。進而使用Top-Down質譜技術確定每種蛋白質異構體的分子量和序列信息。
應用領域:
使用質譜技術,能夠將一維或二維電泳的分辨力和相對定量的優(yōu)勢與Top-Down蛋白質組學相結合;
完整蛋白分子量測量,使用質譜技術快速的確認一維或二維電泳凝膠中蛋白質的分子量;
從膠內(nèi)酶切過的凝膠中回收多肽混合物,或先回收完整蛋白質再進行溶液內(nèi)酶切,最后用于Bottom-Up蛋白質組分析;
使用質譜技術對凝膠中的蛋白質樣品進行鑒定和特征描述;
確認蛋白質的修飾狀態(tài),使用二維電泳的高分辨力,將蛋白質異構體、降解產(chǎn)物和不同修飾狀態(tài)分離開,快速回收分離開的蛋白質用于質譜分析;
蛋白質的回收和保存,快速的從一維或二維電泳凝膠回收蛋白質并保存用于后期實驗;
生物標記物的發(fā)現(xiàn);
蛋白質藥物降解產(chǎn)物分析;
GPR電洗脫緩沖液:
鑒于蛋白質的多樣性,為了得到更好的蛋白質回收效果,Protea公司開發(fā)了多種電洗脫緩沖液。每種緩沖液都含有酸易分解表面活性劑,在酸性條件下迅速的分解成不與樣品關聯(lián),不具表面活性特性的成分,避免了使用SDS類電洗脫緩沖液,增強了樣品和質譜分析的兼容性。使用GPR-800時,根據(jù)蛋白質的親水性和等電點來選擇緩沖液,能回收到高質量的樣品,得到最佳的回收效率,進而得到可靠的質譜數(shù)據(jù)。